抗日战争时日军侵占广州期间，日军士兵慑于邓世昌的威望和英气，不敢破坏邓氏宗祠。民国38年（1949）秋，邓氏族人字祠堂内创办“世昌小学”。后曾改作妇产院。1957年开始，邓氏宗祠为广州市结核病防治二所使用。“文化大革命”期间，祠内不少文物散失，附属建筑物受到不同程度破坏，部分附属用地亦被违章占用。1989年12月，邓氏宗祠被定为市级文物保护单位，1994年8月，在邓氏宗祠建立邓世昌纪念馆。现在整座建筑恢复了清代式样，祠堂的木雕亦精心复原 ，并涂上油漆，重现了邓氏宗祠的原貌。展品陈列线长80米，通过近600张图片和复印件、雕塑、模型、文字说明等，反 映邓世昌青少年时代、甲午海战及其战后影响，使之成为爱国主义教育的场所。